Se supone que cuando se abre el pdf solo tienes que guardarlo, me parece bastante menos complicado que hacer que los usuarios lo descompriman. Antes cuando los pdf no eran soportados por los navegadores era un coñazo tener que abrir el Reader para leerlo. Ahora es mucho más cómodo que se abra en el navgador, ves que la información que contiene es la que buscabas, ctrl+s y listo. De todos modos con PHP hay un metodo para obligar al navegador a mostrar el dialogo de opciones, + info en este
enlace.
Salud!