Tendrias que usar alias:
Código PHP:
SELECT tablaA.nombre AS nombreA,tablaB.nombre AS nombreB FROM tablaA,tablaB WHERE...
luego para mostrarlo en php
Código PHP:
echo $reg['nombreA'];//muestra el valor del campo nombre de la tablaA
echo $reg['nombreB'];//muestra el valor del campo nombre de la tablaB
Yo le puse nombreA, nombreB pero puedes usar el alias que desees