Sobre PHP
http://es2.php.net/ ==> Completa referencia sobre PHP.
http://www.w3schools.com/PHP/DEfaULT.asP ==> El tutorial de PHP de w3Schools (más paso por paso que PHP.net, que es mas para buscar información sobre funciones que conozcas u objetos).
Sobre MySQL (en general SQL, pero MySQL es gratis)
Sueles aprenderlo con PHP, pero por si las moscas:
http://www.webtaller.com/manual-mysq...nual_mysql.php ==> Si te encuentras tienes bastante información allí.
Sobre Javascript
http://www.w3schools.com/js/default.asp ==> Página de w3Schools sobre JS
http://www.w3schools.com/jsref/default.asp ==> Referencias Javascript.
Por lo demás,
http://www.w3schools.com/ tiene muchos tutoriales que te pueden venir muy bien.