Por fin he dado con la solución a este problema.
Era cuestión de valerse de triggers en el updatepanel para poder abrir el archivo dentro de un updatepanel.
adicionando debajo de la declaración del updatepanel se adiciona
<Triggers><asp:PostBackTrigger ControlID="ImageButton1" />
</Triggers>
Donde se establece que a cualquier acción del control ImageButton1 (para este caso) tenga un comportamiento sincrono establecido por asp:PostBackTrigger y no asp:asyncPostBackTrigger.
Comparto la respuesta, por si alguien tiene el mismo problema.
Un saludo y gracias por la ayuda.