Inno Setup!

[AREA 51]

Me parece que eso que buscas no es posible en el InnoSetup, el Disk Spanning solo tiene dos opciones No (por defecto) o (Yes) al activarlo ya te crea el setup independiente de los archivos BIN pero esa opción debe de traerla ya el programa y no se puede modificar y por otro lado si deseas hacer un exe solo que ocupe mas de dos Gigas tampoco te dejara sin el Disk Spanning, yo comparto esta filosofía ya que no me gusta tener un ejecutable tan pesado entre otras razones porque algunos antivirus se eternizan verificando el archivo. Por otro lado puedes probar con otro instalador como el Nullsoft Scriptable Install System.