Ctr+Alt+Retroceso es una secuencia nativa de XFree, no de GNOME ni de KDE. Con lo que o la desactivas de alguna forma o el usuario la puede ejecutar.
Por otro lado intenta capturar cuando el usuario pulsa Ctrl+Alt+FX y haz un simple g_print, lo mismo se anula la acción de abandonar el servidor X para pasar a una consola de texto.
Cita: lo unico seria Ctrl+Alt+spr y eso reiniciaria la maquina y luego al entrar de nuevo se
encontraria con mi aplicacion..
Aquí te equivocas, si consigue reiniciar la máquina y en el arranque introduce algo como:
Ya la jodiste, porque no se le pedirá ninguna password y tendrá privilegios de root.
Lo que tu pretendes "por motivos estéticos" puedes solucionando eliminando TODAS las consolas menos 1, bajo la que "correrá" INIT.
Salu2.Ferdy