Tengo el mismo problema con la galeria de mi web con un menú de joomla, cuando carga lightbox, el menú queda por encima de todo, incluso de un módulo de yootheme que se llama toppanel, queda debajo, es decir este menú siempre está encima, para variar es en css la web es esta
www.misionespiuraperu.org/nueva
Si alguien me echa una manita con eso le agradezco de antemano!
Acabo de activar el toppanel se llama Lo mejor, está en la parte central superior!