Yo me he puesto a intentarlo y cuando le doy al boton me sale directamente,os paso el codigo y a ver si veis algun error y biperina se puede fijar.Un saludo
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<title>Documento sin título</title>
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#capa {
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}
.Estilo1 {font-size: 36px}
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function hola(){
setTimeout(document.getElementById("capa").style.v isibility="visible",5000);
}
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<div class="Estilo1" id="capa">HOLAAAAAA</div>
<label> <br>
<br>
<br>
<input type="button" name="Submit" value="Botón" onClick="hola();">
</label></body>
</html>