Pues me pasa lo mismo... no diferencian sobre el raiz del hosting y el raiz de posicionamiento del dominio.
Y el problema no es el global.asa, es principalmente cualquier aplicacion asp.net que quieras meter, ya que te ocurrira lo mismo.
Segun su guia faq tiene que estar ubicado en el raiz del hosting.
http://faq.1and1.es/programacion/aspnet/aspnet_2/1.html
Hay una opcion en el panel de control, archivos web que se llama configuracion de la aplicacion, y puedes configurar hasta 5 rutas... mira a ver si ahi se te corrije.
Y si encuentras como arreglar lo del asp.net te agradezco la ayuda...