Ya he conseguido la respuesta en el foro de GWT, que era más adecuado para la pregunta.
In html:
<div id="header">Your stuff here</div>
<div id="content">loading...</div>
<div id="footer">Your stuff here</div>
In gwt:
RootPanel.get("content").clear();
RootPanel.get("content").add(yourContentWidget);
Gracias a todos los que os habéis molestado en leer mi pregunta.