Hola locmasm
como modificaste la variable max_allowed_packet?
Si estas en windows busca la carpeta donde se instalo el mysql y edita el archivo my.ini y modifica dicha variable
Si esta en linux debe estar en una ruta parecida a esta /etc/my.cnf y modificas dicho archivo
Ejemplo
Con eso configuras el servidor
Pero tambien es recomendable configurar el cliente antes de subir el archivo
Lo puedes hacer asi antes
Saludos!