Problema con prototype con el response

[guzmange]

Hola gente, necesito una cierta informacion si es que es posible, estoy utilizando prototype para manejar ajax, y en lo que estoy haciendo necesito que la respuesta que viene con ciertos datos me sea cargada en una variable javascipt para luego manejaral fuera de esa funcion, lo que suelo utilizar y sale correcto es cargar esa respuesta sobre un input o algun elemento html, pero yo quiero manejar el dato de esa respuesta en una variable java.
lo explico paso para ver si me entienden mejor.
me escriben algo en un input, ese algo lo tomo con prototype y lo proceso y el resultado de ese proceso me lo devuelve con el mismo prototype utilizano ajax y me lo carga en una variable que la unica forma que tengo de verla es escribiendola en html , yo quiero guardar ese resultado en una javascript, de forma de poder hacer algun otro proceso o un simple alert con la informacion con el contendio de esa respuesta.
se puede hacer? necesito ya que estoy quemandome la kbza! agradesco la respuesta!!!