Exacto.
Depende también de la forma de abrirla puedes encontrarlo de una u otra forma.
Si está dentro de una función suele llamarse así:
ventanita=window.open('pagina.htm','nombreventana' ,'atributos')
En este caso, la ventana se llamaría ventanita, aunque el segundo parámetro dijera 'pepe'
En cambio si se ha abierto directamente el nombre de la ventana vendrá dado, efectivamente, del segundo parámetro.
onAlgo="window.open('pagina.htm','ventanita','atri butos')"
