Claro mira... vos podes hacer el sub proceso "MAIN" y que tu proyecto no tenga forms...
Si te vas a las propiedades del proyecto vas a ver una opcion que dice "Objeto Inicial" y va a tener seleccionado "Form1", pero si miras mas abajo vas a ver que tambien tiene "Sub Main"... bueno seleccionas ese y listo...
Es decir en un Modulo creas un sub proceso sub main quedaria algo asi
Código:
Public Sub Main()
TU CODIGO
MAS CODIGO
LLAMADA A OTRAS FUNCIONES, O PROCESOS
End Sub
Ahora bien, vos tenes programado ya en un proyecto que si tiene form, una funcion que cada 10 minutos hace algun "backup"... seguramente tenes un form y dentro de un form tenes un timer, que cada 10 minutos hace eso...
Lo que podes hacer es agregarle el sistema de systray... para que cuando el usuario cierre el programa, en realidad solo se ponga en systray (al lado del reloj)... Y no le moleste en la barra del menu inicio... Para luego podes seguir con lo que estaba haciendo.