buenas!!!
me respondo porque ya encontre la solucion y a lo mejor a alguien mas le pueda servir....
el dato era que tenia que poner toda la secuencia
el formato de busqueda quedo asi
Código:
$bar1 = substr($buscador, 0, 4); //$bar = 'yucg'
$bar=preg_replace ( "/^([a-z]+)G(\d+)([a-z]+)(\d+)$/i", '$2', $buscador);
$prueba = $bar1.$bar;
$query = mysql_query("SELECT * FROM archivo WHERE rug LIKE '$prueba%' ORDER BY nombre, seccion"); //Busca los Elementos de la Delegacion
?>
Gracias a todos los que me respondieron y
un saludo!!