Hola, échale una ojeada a este link:
http://codex.wordpress.org/Template_Tags/wp_tag_cloud
En tu archivo wp-includes/category-template.php te esta diciendo que el valor por default de la variable
unit es
pt, debes cambiarlo ahi (creo) y luego cambiarlo en el codigo que usas para hacer la nube:
Código php:
Ver originalwp_tag_cloud('smallest=8&largest=22&unit=em&number=50&');
saludos y suerte