Torus,
Lo primero que debes aprender es SQL, que es el lenguaje de consultas. MySQL lo usa, aunque con algunos cambios. Yo te recomiendo que veas estas páginas, aunque hay muchísimas más:
http://www.aulaclic.es/sql/f_sql.htm http://www.w3schools.com/sql/default.asp http://www.mysql-hispano.org/page.php?id=14
Por supuesto, para las funciones y demás de MySQL, el manual oficial y MySQL con clase:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/es/index.html http://mysql.conclase.net/curso/index.php
Debes aprender a realizar las búsquedas (group by..., funciones como AVG, MAX, MIN, etc., y un uso adecuado de los cruces inner join, left join, etc.), pero cuando sepas lo básico, aplicarlo a tus bases dependerá de la estructura de las mismas; por eso conviene dar un repaso a la normalización de bases, para no tener que corregir la estructura. Es decir, la estructura dependerá en alguna medida de los resultados que quieras obtener. Si tu estructura no es la correcta, tendrás grandes dificultades para obtener lo que quieres.
Como consejo final, echa un vistazo al foro, tanto en bases de datos como MySQL, y también en los foros de Oracle, SQL, PostgreSQL, porque todas son bases de datos que emplean el lenguaje SQL. Y si tienes alguna duda, plantéala con todos los datos: gestor y versión que empleas, estructura de tus tablas y relaciones, tipos de campo, ejes. de cómo guardas los datos y lo que quieres sacar, y ya verás que alguien te echa una mano: no dudes en preguntar sobre la sintaxis y lo que hace cada parte; pero piensa que sin subconsultas tendrás que hacer varias consultas y trabajar con programación, por lo que te conviene (ves que soy pesado) una actualización.