Usuarios...donde almacenarlos?

[Fueguino]

Buenas, se me ha surguido una inquietud.

Actualmente estoy desarrolando un sistema que usara una base de datos mysql. Pero como la idea es tener todo en un solo programa quiero dejar de lado SQL e incluir archivos, que se puedan crear con el programa.

Ahora bien, la idea del programa es que trabaje con varias máquinas, siempre apuntando a un servidor q tendra los datos. Uno de los datos que tengo son los usuarios, pero... como lograr que esten "protegidos" a manos maliciosas?

Es decir, existe alguna forma de guardar los usuarios de forma segura y que no puedan modificarlo (o por lo menos fácilmente) como un archivo de texto?