Hola fondasopapo!!
Según dices, solo te da la opción de importar marcadores de Internet Explorer. Creo que estás seleccionando la opción incorrecta para lo que quieres hacer.
En efecto, desde el menú ARCHIVO-->IMPORTAR, Firefox solo importa marcadores de Internet Explorer. Pero existe otra opción, la que seguramente utilizaste para exportarlos antes de formatear.
Ésta, te lo recuerdo, se encuentra accesible desde el menú MARCADORES-->ORGANIZAR MARCADORES.
Desde ahí podrás realizarlo sin nigún problema seleccionando el menú IMPORTAR Y RESPALDAR-->IMPORTAR HTML.
Saludos!!