Cuántos más niveles añadas, menos importancia tiene para los buscadores. Pero como todo no hay que tomarlo al pie de la letra. Si una web tiene muchas páginas, es anti natural que el contenido no esté organizado en carpetas y subcarpetas.
El nombre de la carpeta tiene mucha relevancia (aparece en la url), sin abusar con la cantidad de keywords porque las urls muy largas no son recomendables.
En este caso decide mejor en función de la usabilidad de la web, a la larga acaba beneficiando.