Claro, es que si pongo valores porcentuales a los laterales, no ocupará siempre desde el borde del explorador a la capa central.
En el ejemplo que puse, he mirado y se ve que en su día en la capa #contenedor (que realmente es solo una capa elástica) no tiene ninguna medida. Solamente el margen hacia los dos lados es 0, pero ésto no tiene nada que ver en el fondo. ¿O si? Que cacao.