Carga Apache

[sysdebian]

Pues o bien tienes una pagina que tiene bastantes scripts bien grandes que consumen muchisimo o tienes el server hecho una pena, o configuración por defecto, que viene a ser lo mismo cuando se le pide un poco al servidor.
Yo soy "anti-paneles" sobre todo a la hora de hablar de rendimiento, pero entiendo que hay gente que no le vale el vi o el vim. No obstante para webs grandes... mejor pillate un sysadmin que si que sepa manejar el vim :)
Los parámetros que has puesto ahí son una mínima parte en cuanto a optimización se refiere.
Si solo has tocado eso, tienes que mirar mas cosas:
sistema operativo: por defecto los basados en redhat... tienen que optimizarse mucho.
paneles: añaden latencias ya que trabajan con muchos enlaces simbolicos.
mysql: has tocado algo ?
pero bueno, habría que estudiarlo.
Mira primero qué esta consumiendo tus recursos, analiza que recursos son los que se acaban y actua en consecuencia.
Suerte.