Alguien sabe como proteger archivos en php?

[buscand]

Ok. gracias por responder, pero al cambiar los permisos luego los usuariosno tendrian problemas en ver ciertas paginas de la web?
Porque desde el servidor puedo proteger carpetas, el problema es que luego los usuarios no pueden ver archivos de esa acrpeta que deberian mostrarse en la parte publica de la web. Lo que ocurre es que no quiero que algun usuario mal intencionado tenga acceso a aprtes de la we pk no quiero que se vea y actualmente se ven esos archivos ordenados en carpeta tipo servidor.como cuando tienes una web en localhost sin index y te aparecen todas las carpetas en ordes.
ayudaaaaaaaaaaaaaaa