se refiere a ke si no te la reconoce cuando no te funciona por ejemplo el audio.. video.. mouse.. etc...
respecto al .bin debes darle permiso de ejcutacion.. el comando es:
Cita: chmod a+x jdk-6u12-linux-i586.bin
y luego para ejecutar
Cita: ./jdk-6u12-linux-i586.bin
la forma grafica es dandole click derecho.. propiedades y verificar el cuadro donde salga "permitir archivo ejecutable" o algo parecido..
Saludos!