Sólo un sistema de validación te podrá llevar a cabo tan aburrida tarea:
Google Sitemap Validator
No sé, ahora, hasta que punto ha tenido sentido el desarrollo del
hilo anterior.
Porque en el mismo asegurabas tener cerca de 10.000 URLs y la limitación de 50.000 URLs no está siendo vulnerada; asi también como el tamaño máximo del sitemap (10 Mb) tampoco está comprometido.
Sugería yo 1 solo sitemap; ahora bien, vas a hacer tantos sitemaps como secciones. 
Asimismo, te recomendaba el uso de software gratuito; ahora vas a escribirlos todos a mano.
Tengo la sensación que estás haciendo gala de un derroche de recursos inimaginables. 
Adios!