Si usas dojo, por que no usas su propia libreria para ejecutar los scripts?, recuerda que los elementos que los crees por un tag, no se pueden crear ya que dojo los carga al cargar la pagina, y al ejecutar la respuesta ya dojo no tiene conocimiento.
Tienes que buscar en el manual de dojo para que veas si hay una función de re-init o algo por el estilo, en el foro de Frameworks, me supongo te pueden ayudar más al respecto.
Saludos