No hay una configuración por defecto. El script intenta averiguar de qué tipo de datos se trata basandose en el contenido de las celdas de la primera fila.
Y por lo que he descubierto, el script tiene un bug: No detecta
0 como dígito válido en la primera o única posición (de hecho no detecta como número ninguno que empiece por "0"). Así que no es ningún error por tu parte sino que es un defecto del tablesorter.
Iba a enviarle un mail al autor, pero me he puesto antes a buscar por la red, y es un error que ya han encontrado otros antes y está avisado ya.
Es
posible que incluso esté arreglado en la última versión que hay
en el repositorio. Si quieres prueba a bajarte esa versión y mira a ver si con esa versión funciona.