checked a todos los checkbox

[SPAWN3000]

Podrias utilizar algo de logica:
(Siempre hay alternativas para todo...)

1. Calculas el total de check en el momento de la creación de la pagina y almacenas el parametro y lo dejas en javascript.

2. Ahora haces un for que establezca check a todos desde arriba y desde abajo de la lista.

Digamos:
el total de check es 1000.
Comienzas:
i = 0;
j=total elementos;
Un for (i=1 hasta 500){
document.forms[objForm].elements[i].checked=true
document.forms[objForm].elements[j].checked=true
j=j-1;
}
Asi, logras dos trabajos en uno y tu tiempo se reduce casi a la mitad. y si aun es lento, puedes partir el grupo en cuatro, con cuatro variables y listo...
- También puedes paginar tu listado, asi el usuario no se cansa de esperar...

Un saludo.