Cita:
Iniciado por skullz-group 
Para que todas tus urls queden sin el index.php tienes que tocar el panel de administración del componente y el archivo .htaccess
Sard, si utilizas el sh404sef, también entra al sh404sef configuration-> Advanced -> Advanced Component Configuration -> Rewriting mode (with .htaccess (mod_rewrite)
y listo!! ya no vas a tener los index.php
Saludos,