Cita:
Iniciado por mazatl 
1º si no tengo conectado el disco usb antes de arrancar da error y no inicia nada.
Lógico. Enchufa el disco y reinicia el equipo.
Cita: 2º si inicio en windows no reconoce el disco usb
¿Con qué sistema de archivos has formateado el disco? Si es EXT3, lo que te ocurre es lógico, puesto que Windows no lleva soporte de serie para ese tipo de particiones. Pregunta en el subforo de Windows cómo poder leer particiones EXT3 desde dicho sistema operativo.