Cita: en lo personal uso el Javascript cuando ya está terminado todo el sitio, no al comenzarlo
Esa es la clave, utilizar javascript solamente cuando sea nesesario, pero al mismo tiempo posibilitar el uso de las caracteristicas agregadas con javascript pero sin ellos, aunque la pega es que esto en muchos casos es imposible.
Dice que el 1%, pero ese uno por ciento pueden ser millones.
Creo que en CSS, y si no me equivoco en XML, estan intentando solucionar esto en parte.
Saludos.