¿Cómo indentar código desordenado rápidamente?

[Rafael]

Pues sí, una pena.
Probablemente se pueda elaborar una serie de reglas de sustitución para cierto lenguaje, por ejemplo en la opción replace (ya sea de un editor o quizá en php)
Poner
replace function ()
/n/r function ()
Quizá eliminar dobles tabs, return + tab, etc. El problema será el anidado...

Para Html está más fácil:
<h1>Bla bla</h1>
/n/r /n/r <h1>Bla bla</h1>