Hola
mape367 ! 
Busqué información en Google al respecto.
En todas la fuentes encontré negativas, muy probablemente no vas a poder hacer eso desde un proyecto Flex o Air.
Pero en la búsqueda me encontré con un artículo muy interesante, haciendo uso de una tecnología como lo es PHP, puedes comunicarte con los puertos seriales:
http://www.communitymx.com/content/a....cfm?cid=8658A
Así que podrías hacer uso de las 2 tecnologías para lograr el objetivo.
Nos cuentas si fue viable, y si llegas a implementarlo, esperaremos por un tutorial si así lo decides.
Un saludote ! 