Pues bueno el mssql_num_rows te sirve para saber cuantos valores te devuelto tu select, por ejemplo si tienes un condicion para saber si existe o no el usuario; realizas el select y si el mssql_num_rows te da que es igual a 0 entonces dices que no existe o bien si es igual a 1 kiere decir que si existe el usuario.
Saludos
