location.href = "http://www.everestltda.com/extract/empresarial.php?empresa='<?echo $empresa; ?>'&placa='<?echo $placa; ?>'";
¿Desde cuando para pasar valores por URL hay que usar comillas?
Tu estas haciendo esto:
http://tupagina.com/index.php?var='valor'&var2='valor2'
Es asi:
http://tupagina.com/index.php?var=valor&var2=valor2
Se agrega \' porque tienes los magic_quotes_gpc activado, y esto escapa todas las comillas provenientes de GET/POST/COOKIE/etc...