OK, el código tendría que ser así:
<div id="header" style="width: 340px: float: left"><center><img src="themes/$settings[theme]/images/logo.gif" border="0" alt="" /></center>
</div>
<div style="width: 80px; float: right">
<a href="http://bitsofbusiness.eu/es/" target="_blank"><img align="right" src="themes/$settings[theme]/images/ES_flag.jpg" border="0" alt="" /></a><a href="http://bitsofbusiness.eu" target="_blank"><img align="right" src="themes/$settings[theme]/images/UK_flag.jpg" border="0" alt="" /></a>
</div>
Aunque parece que fuera HTML veo que es PHP en realidad, solo que lo has colocado de ese modo, en fin. Espero que te sirva.