la funcion que tienes se supone que es ésta:
function MM_openBrWindow(theURL,winName,features) { //v2.0
window.open(theURL,winName,features);
}
en el php estamos intentando abrir directamente un jpg:
echo "<a href=\"#\" OnClick=\"MM_openBrWindow('".$ordner."/".$files[$count]."','ima1','width=650,height=500')>aqui_el_thumb.j pg</a>";
Intentalo y si no pega al menos el error que te salga asi podemos ayudarte
otro consejo es que "pares para afilar el hacha" si dices que llevas 10 horas es probable que estes pasando por alto una tontería que con el cansancio no conseguirás ver.
Suerte