Haz hecho un mal uso de las comillas, la comilla doble empieza aquí:
document.write("....
y termina aquí:
.... this.arget, "....
con lo que obviamente genera un error porque no hay ni punto y coma y además lo demás no es válido. Bien, la solución? Solamente usa bien las comillas, de este modo:
document.write("<a href='../acuhtml/modificanpmay.htm?tipo=%%tipo%%&numer
o=%%numero%%' target='popup' onclick='window.open(this.href,this.target, \'width= 100, height=100\'); return false;'>%%pmay%%</a>");
Espero que te sirva.