Posiblemente tengas definido en alguna parte:
que hace que las celdas vacias no se muestren ni se respete su espacio por las adyacentes.
Para que no "desaparezcan" o bien le inyectas un valor ( puede ser incluso un espacio vacio: ) o cambiar el valor de
Para saber si es esto, basta con usar ie6 o anterior, que no entiende de esa propiedad. Por lo que ese problema no se te tendría que presentar.
Creo recordar.