lo que pasa es que estas confundiendo las cosas, el disco de inicio no es un instalador y si tu CD de Win98 no es booteable de esta forma nunca vas a poder instalarlo
.
si el disco duro ya esta formateado lo que tendrías que hacer es iniciar con el disco de inicio de Win98 y elegir la opción " con compatibilidad para cdrom... ", una vez hecho esto te va a salir A:\>... hasta aquí todo ok
.
ahora lo que tienes que hacer es pasarle el sistema al disco duro para hacerlo booteable, que es lo mismo que copiar de forma manual los archivos io.sys, msdos.sys, autoexec.bat y config.sys, pero lo haces de forma automática con el comando:
A:\>sys C: (enter)
una vez hecho esto creas una carpeta en el disco duro:
A:\>C:
C:\>md win98
una vez creada copias el contenido del CD a tu disco duro, esto para hacer una instalación mas rápida y de paso tener los instaladores en tu maquina:
C:\>copy X:\win98\. C:\win98 (dejar 1 espacio entre \. y C:\)
reemplaza X por la letra de tu unidad de CD, el disco de inicio te crea una unidad virtual, no recuerdo si te la crea como D: o E:, en todo caso verifica cual de las dos es tu CD.
una vez que termina la copia reinicias tu equipo sin el disco de inicio y te preparas para la instalación, esta vez debería prender el equipo con una pantalla negra y en C:\>...
entras a la carpeta win98...
C:\>cd win98
escribe install o instalar según sea Win98 en español o ingles y listo.