Disculpar... poco despues vi en google una forma de hacerlo. Fue buscar un poco y lo encontré, asi que pido disculpas, mi única excusa es que en el trabajo solo podemos conectarnos 5min. a internet y por las prisas pues...
Agradecería me dijeran, como sería la forma correcta y estándar de agregar el flash a un HTML. Ya que con lo del object y demás, no me lo muestra en firefox.
Respuesta al problema de las capas:
1-. Poner dentro del object la propiedad: <param name="wmode" value="opaque" />
2-. La capa flash, tiene que tener un z-Index inferior a la otra capa.
Saludos.