Mi pregunta era donde ponia dicho código que no quedaba claro al menos para mi que no controlo mucho de javascript.
Lo he echo de la siguiente manera:
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd">
<html>
<head>
<script type="text/javascript">
function abrirventana(){
open("Prueba2.html", "nombre", "location=no,menubar=no,scrollbars=no,status=n o");
}
</script>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">
<title>Insert title here</title>
</head>
<body>
<a href="#" onclick="abrirventana();"> enlace </a>
</body>
</html>
He puesto un onclick y en el function llamo a dicha ventana...
No se si podra poner de forma mas resumida o menos código ya que son muchas las ventanas que llamo...
Muchas gracias.