Hola loganbdn
En una ocasión tuve un problema similar y no lograba eliminar el maldito reborde del iframe en iexplorer, así como el scroll (que en ese proyecto no debía tener). En los otros browsers: ff, opera y chrome no salía el reborde, pero en ie no había forma de eliminarlo y que pasase la validación XHTML 1.1... pero conseguí eliminarlo con un truco de posicionamiento, y en todos los navegadores se veía igual y, además, validaba.
Lo he recuperado y te lo he subido a este almacén (y a todos los que estén interesados):
http://www.box.net/shared/nl15yzj2lh
Comenta si esto, ajustado a tus necesidades, soluciona tu problema.
Saludos