Pues eso, no le estás especificando qué codec usar. Prueba con:
Código bash:
Ver originalffmpeg -i video.flv -f avi -vcodec mpeg4 video.avi
Soy un ignorante en cuanto a multimedia se refiere, pero hasta donde sé AVI puede contener los codecs MPEG-1, MPEG-2 y MPEG-4, ffmpg no puede adivinar cual quieres utilizar sin que lo especifiques.
Suerte
