Hola.
Para ejectutar un .exe y mandarles parametros puedes usar esto:
System.Diagnostics.Process.Start(”Proceso.exe”, “Parametro1″, “Parametro2″);
Ahora si lo que quieres es saber como recibir parametros desde un exe mira este ejemplo:
http://solucionesdotnet.blogspot.com...ar-un-exe.html
Espero sea eso lo que necesitas, sino avisanos.
Suerte.