Cita: En primera instancia, sería bueno que le consultes a tu proveedor de hosting si pueden hacer una monotorización intensiva de tu equipo durante un período de tiempo prolongado (24 hs por ejemplo), a fin de detectar donde y cuando es que se produce ese alto consumo del que el VPS te informa.
Si tu VPS no es administrado, esta tarea la debes realizar tú, no tu proveedor. Si no sabes cómo hacerlo o no tienes los conocimientos suficientes y tu VPS no es administrado (esto es, lo administras tú) y se lo pides a tu proveedor, lo más logico es que te cobre por ese servicio, a no ser que esté desesperado y haga todo gratis.