extraño que tengas un disco de 80Gb con Fat16, esto porque prácticamente se uso en Win95 y primeras versiones de Win98, para Win98Se en adelante lo normal era usar Fat32 o NTFS en caso sea basado en NT, aparte de desperdiciar espacio/capacidad de disco al no soportar particiones grandes...
http://support.microsoft.com/kb/310561.
sobre el uso del convert (
http://support.microsoft.com/kb/307881) en teoría no deberías tener ningún problema de perdida de datos, pero... siempre es recomendable tener un backup por si Murphy esta cerca
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