esta protegido mi codigo???

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bueno ahora se encuentra servidores virtuales muy baratos en los cuales puedes alojar tu script.

pero para decir si tu script necesita una codificación, una encriptación etc.. como trabaja tu script?
en un hosting serio no no van a cojer nada de lo que tengas dentro al menos que sea ilegal, de lo contrario estas a salvo.
si el script lo baja el usuario para su uso ahí tomaríamos una decisión de encriptar el script.
todo depende de que hace tu script y como trabaje.
salu2