Hola, pitxulin.
Tienes que utilizar la propiedad z-index. Mira este ejemplo:
<div id="Layer1" style="position:absolute; width:200px; height:115px;
z-index:1; left: 280px; top: 40px; background-color: #00FF66; layer-background-color: #00FF66; border: 1px none #000000">Capa 1</div>
<div id="Layer2" style="position:absolute; width:200px; height:115px;
z-index:2; left: 300px; top:60px; background-color: #00CCFF; layer-background-color: #00CCFF; border: 1px none #000000">Capa 2</div>
La capa 2 (color azul) queda por encima porque el z-index es más alto.
Sobre lo de poner la capa por encima de los listbox, siento no poder ayudarte. Yo tampoco lo he conseguido.
Saludos,