Podrías usar, entre los tags head, window.onload:
Código PHP:
<head>
<script>
window.onload=function(){
tuFuncion1(tusArgumentos);
tuFuncion2(tusArgumentos2);
}
</script>
</head>
<body>
O llamar a la función antes del tag body de cierre:
Código PHP:
<script>
tuFuncion1(tusArgumentos);
tuFuncion2(tusArgumentos2);
</script>
</body>
</html>
O usar addLoadEvent:
http://simonwillison.net/2004/May/26/addLoadEvent/